厂区的规划设计严格遵循高起点、高水平的原则，从设计到施工，从厂房的布局到设备选型均严格按《药品生产质量管理规范》（2010年修订）进行。人流、物流分开，车间的工艺布局合理，设备选用国内先进制药机械，使产品质量得到了有力保障。

生产车间、锅炉房、动力房、污水处理站、检验室、仓库相对独立。车间位于生产区的中间，厂区的东面中间位置。厂房生产区总面积为21090㎡，辅助区为3140㎡。其中青蒿素车间占地面积1300㎡，总面积为6000㎡。洁净区的面积为315㎡，其设计严格按GMP要求，工艺布局合理，人流、物流分开，不同岗位之间工作互不妨碍。